大昭寺莲花生大士
莲师坐姿：
呈国王像游戏姿，表莲师已彻证一切轮回、涅盘法性的本质而游戏三界，其解脱自在、任运度生悉皆究竟圆满。密教中的三密相应，指行者以修持本尊的咒语、印契及观想本尊相而速证悉地；
莲师眼神：
莲师怒目直视的眼神，是为调伏一切刚强难伏的魔外众生而示现的忿怒相，但内心极具圆满的智慧与慈悲。了义来说，莲师的睁眼直视，更象征了修行者皆应由「内观直视」那众生原来本具、无造作的心性而证得佛果。大部份的显教佛像均是慈眉善目的，这是为了接引有善根的众生，但对于恶性阐提的大力妖魔恶鬼，密宗的本尊常现忿怒像以度化降伏之，此尊莲师是寂静、忿怒悉皆圆具之相。
蓄发及蓄胡：
表修持密法行者若如法精进，不分出家、在家俱可成就而证得无上佛果，莲师所示现的无二分身大成就者中，有很多都是示现在家相的行者。
莲师同时身着白、红、蓝法服、国王服与袈裟服：
莲师身具「国王」与「法王」的身份，表莲师于显密教法得圆满总持而任运自在，更表世出世法不二、轮回涅盘不二、明空不二、空乐不二、悲智不二、空悲不二，一切相对性、绝对性法性缘起现象的圆融整合与圆满具足。「法服」乃表莲师善能以法自服，更能以法服人的胜义，五种法服表莲师身、口、意、功德、事业吉祥圆满成就，具足五部如来之最上心要与成就，具足四部瑜伽（作、修、瑜伽、无上瑜伽）及三种密续（父续、母续、无二续）的命根与成就，具足五根、五力转五蕴、五毒为五智（成所作智、妙观察智、平等性智、大圆镜智、法界体性智）而成就五身（法身、报身、化身、大乐智慧身、法界体性身）的境界。
大伏藏师秋吉林巴取出的莲师法王冠
法王冠：
在世法上表莲师为当时西藏的国王，爱民如子，堪为君主人王，故能着此王冠。以出世法而言则表莲师为集十方三世三宝三根本于身的无上法王，更是代表十方三世诸佛教化众生的密宗教主，能赐予一切众生世间法、出世间法的毕竟安乐解脱。
帽羚：
由于莲师在西藏一度身兼国王与法王，莲师法冠上的帽羚（帽顶之羽毛）在世间法上乃表国王独具的威权，教化臣民，一归仁王统治。在出世法上则表「一真法界中的法性一味」、「一佛乘」、「一即一切」、「与密宗本初原始佛－普贤王如来无二无别」之义。
帽羚下的「半五钴杵」：
表莲师是传承自密宗本初佛普贤王如来，及其以下五方五佛的传承持有者及预戴者。（五方五佛为中央大日如来、东方阿闪如来、西方阿弥陀如来、南方宝生如来、北方不空成就如来），密宗重视「传承」的程度，由此可知。
南无蓮花生大师法器之金剛杵
莲师右手持「九钴杵」
一般的莲师像右手是以期克印（密宗手印的一种，是为降魔印），持「五钴杵」，表莲师具足「五佛五智」，能转五毒为五智。而这尊莲师像的右手则以期克印持「九钴杵」，此乃因藏密红教的判教将显密教法判为九乘次第，「九钴杵」表莲师是九乘次第的圆满成就者，及传承法教的持有者。同时「九钴杵」亦表莲师对「四生九有」一律度化与调伏的慈悲心与行愿力的圆满具足。
桑耶寺落成的开光仪式上
莲花生大师曾使用过的铃杵
南无蓮花生大师法器之金剛鈴
南无蓮花生大师法器之金剛鈴杵
莲花生大士肉体飞身去罗刹国前
途经贡塘山口所留的足迹石
莲师手印
咒语种子字者 —— 语密也
印契者 —— 身密也；
观想本尊相好、法器及身庄严者 —— 意密也。
又咒字有「声」与「菩提心」之别，印契有「有形」与「无形」之别，本尊形相有「清净」与「非清净」之别。声为菩提心之名词文字，菩提心者，声字之实体，悉为诸法实相所含摄之另名异相。有形印契者，为本尊所结之手印或所持法器之三昧耶形貌相状；无形印契者，为诸尊及真言行者之本誓念愿，有形与无形印契皆是以具体与抽象方式诠释出诸法实相面貌的一体两面及本尊的特色与特质。清净者指无相之形像；非清净者，有相之形像是也。
行者由是修行纯熟精进，入于本尊究竟三昧－寂然无相，本尊与行者自身，合为不二一体－入于实相无相三昧，「入我我入」－证入法性不可思议解脱门，斯乃究竟。密法以有相入无相，空有圆融双超，不坏真俗二谛，所谓「本尊」，不了义说乃指诸尊；了义说，则指「人人本具之尊贵自性」。有相而不着相，有形而不着形，必乃内观自性，悟入诸法实相，斯乃密乘正义。而诸尊相好庄严身相，除诸尊为累劫熏修万德所聚之殊胜果报，及为有缘众生所示现之幻相外，无非以此摄受、导引众生悟入法性实相之门，其善巧方便无非源自诸佛菩萨本尊内证的无尽大悲心及本誓愿力。由不了义法而悟解了义法，
方能一探诸尊本怀，所谓「菩提心为因，大悲为根，方便为究竟」者正是如此。
今观此莲华生大士殊胜庄严妙好相，已然说尽一切妙谛法，有缘者若以无相之心观有相之形，内观自心其如如不动体性者，斯乃诸尊所赞叹之正观也。愿诸众生早证菩提，圆满成佛。 ——玛哈瑜伽(生起次第)、阿努瑜伽(圆满次第)、阿底瑜伽(大手印、大圆满)。